FYVE domen
U molekularnoj biologiji FYVE cinkov prst domen je dobio ime po grupi od četiri proteina bogatih cisteinom: Fab 1 (kvaščani ortolog proteina PIKfyve), YOTB, Vac 1 (transportni protein vezikula), i EEA1, kod kojih je nađen. FYVE domeni vezuju fosfatidilinozitol 3-fosfat,[2] na način koji je zavistan od od koordinacije metalnih jona i od baznih aminokiselina. FYVE domen se umeće u ćelijske membrane na način koji je zavistan od pH vrednosti.[3] Ovaj domen učestvuje u vakuolarnom sortiranju proteina i funkcionisanju endozoma.[4]
| |||||||||
| Rani endozomni antigen 1 (EEA1), dimer sa lipidima.[1] | |||||||||
| Identifikatori | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Simbol | FYVE | ||||||||
| Pfam | PF01363 | ||||||||
| InterPro | IPR000306 | ||||||||
| PROSITE | PDOC50178 | ||||||||
| SCOP | 1vfy | ||||||||
| Superfamilija | 1vfy | ||||||||
| OPM protein | 62 | ||||||||
| OPM protein | 1vfy | ||||||||
| |||||||||
Struktura uredi
FYVE domen se sastoji od dve male beta ukosnice (ili cinkova zglavka) čemu sledi alfa heliks.[5] FYVE prst vezuje dva jona cinka. On ima osam pozicija koje potencijalno mogu da sadrže cink, i karakterističan je po tome što ima bazne aminokiseline oko cisteina. Mnogi članovi ove familije takođe sadrže dva histidina u motivu:
FYVE prst je strukturno sličan sa RING domenom i PHD prstom.
Primeri uredi
Sledeći ljudski proteini sadrže FYVE domen:
Reference uredi
- ↑ Dumas JJ, Merithew E, Sudharshan E, et al. (November 2001). „Multivalent endosome targeting by homodimeric EEA1”. Mol. Cell 8 (5): 947–58. DOI:10.1016/S1097-2765(01)00385-9. PMID 11741531.
- ↑ Gaullier JM, Simonsen A, D'Arrigo A, Bremnes B, Stenmark H, Aasland R (July 1998). „FYVE fingers bind PtdIns(3)P”. Nature 394 (6692): 432–3. DOI:10.1038/28767. PMID 9697764.
- ↑ He J, Vora M, Haney RM, et al. (September 2009). „Membrane insertion of the FYVE domain is modulated by pH”. Proteins 76 (4): 852–60. DOI:10.1002/prot.22392. PMC 2909462. PMID 19296456.
- ↑ Leevers SJ, Vanhaesebroeck B, Waterfield MD (April 1999). „Signalling through phosphoinositide 3-kinases: the lipids take centre stage”. Curr. Opin. Cell Biol. 11 (2): 219–25. DOI:10.1016/S0955-0674(99)80029-5. PMID 10209156.
- ↑ Misra S, Hurley JH (May 1999). „Crystal structure of a phosphatidylinositol 3-phosphate-specific membrane-targeting motif, the FYVE domain of Vps27p”. Cell 97 (5): 657–66. DOI:10.1016/S0092-8674(00)80776-X. PMID 10367894.
Literatura uredi
- Stenmark H, Aasland R, Toh BH, D'Arrigo A (September 1996). „Endosomal localization of the autoantigen EEA1 is mediated by a zinc-binding FYVE finger”. J. Biol. Chem. 271 (39): 24048–54. PMID 8798641.
- Stenmark H, Aasland R (December 1999). „FYVE-finger proteins--effectors of an inositol lipid”. J. Cell. Sci. 112 (Pt 23): 4175–83. PMID 10564636.