Domen inhibitora apoptoze
Domen inhibitora apoptoze (IAP ponavljanje, Bakulovirusni inhibitor apoptoznog proteinskog ponavljanja, BIR) je strukturni motiv prisutan u proteinima koji učestvuju u apoptozi, citokinskoj produkciji, i segregaciji hromozoma.[2] Proteini koji sadrže BIR su poznati kao inhibitori apoptoze (IAP), kao i BIRP ili BIRC (engl. BIR-containing proteins). U te proteine se ubrajaju BIRC1 (NAIP), BIRC2 (cIAP1), BIRC3 (cIAP2), BIRC4 (xIAP), BIRC5 (survivin) i BIRC6.[2][3]
| |||||||||
| NMR rešenje strukture BIR domena ljudskog BIRC2 proteina.[1] N-terminus = plavo, C-terminus = crveno, dok je cink prikazan sivim sferama. | |||||||||
| Identifikatori | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Simbol | BIR | ||||||||
| Pfam | PF00653 | ||||||||
| InterPro | IPR001370 | ||||||||
| PROSITE | PS50143 | ||||||||
| SCOP | 1qbh | ||||||||
| Superfamilija | 1qbh | ||||||||
| |||||||||
BIR domeni pripadaju familiji domena cinkovog prsta i karakteristično imaju brojne nepromenljive aminokiselinske ostatke, uključujući tri konzervirana cisteina je jedan konzervirani histidin, sa koordinatno vezanim jonom cinka.[4] Oni se tipično sastoje od 4-5 alfa heliksa i trolančane beta ravni.
Reference uredi
- ↑ PDB 1QBH;Hinds MG, Norton RS, Vaux DL, Day CL (July 1999). „Solution structure of a baculoviral inhibitor of apoptosis (IAP) repeat”. Nat. Struct. Biol. 6 (7): 648–51. DOI:10.1038/10701. PMID 10404221.
- ↑ 2,0 2,1 Silke J, Vaux DL (May 2001). „Two kinds of BIR-containing protein - inhibitors of apoptosis, or required for mitosis”. J. Cell. Sci. 114 (Pt 10): 1821–7. PMID 11329368.
- ↑ Verhagen AM, Coulson EJ, Vaux DL (2001). „Inhibitor of apoptosis proteins and their relatives: IAPs and other BIRPs”. Genome Biol. 2 (7): REVIEWS3009. DOI:10.1186/gb-2001-2-7-reviews3009. PMC 139420. PMID 11516343.
- ↑ Birnbaum MJ, Clem RJ, Miller LK (April 1994). „An apoptosis-inhibiting gene from a nuclear polyhedrosis virus encoding a polypeptide with Cys/His sequence motifs”. J. Virol. 68 (4): 2521–8. PMC 236730. PMID 8139034.
Spoljašnje veze uredi
- Eukaryotic Linear Motif resource motif class LIG_BIR_II_1
- Eukaryotic Linear Motif resource motif class LIG_BIR_III_1
- Eukaryotic Linear Motif resource motif class LIG_BIR_III_2
- Eukaryotic Linear Motif resource motif class LIG_BIR_III_3
- Eukaryotic Linear Motif resource motif class LIG_BIR_III_4
Ovaj artikal sadrži tekst iz javnog vlasništva Pfam i InterPro IPR001370