Tioredoksinski sklop
Tioredoksinski sklop je proteinsko savijanje koje se često javlja u enzimima koji katalizuju formiranje disulfidne veze i izomerizaciju. Sklop nosi ime po kanoničkom primeru proteina sa ovim motivom, tioredoksinu. Ovaj sklop se javlja kod prokariotskih i eukariotskih proteina. Tioredoksinski sklop je primer alpa/beta proteinskog savijanja koji ima oksidoreduktaznu aktivnost. On ima prostornu topologiju koja se sastoji od četvorolančane antiparalelne beta ravni smeštene između tri alfa heliksa.
Molekul ljudskog tioredoksina (1ERT) | |||||||||
Identifikatori | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Simbol | Thioredoxin | ||||||||
Pfam | PF00085 | ||||||||
Pfam klan | CL0172 | ||||||||
InterPro | IPR013766 | ||||||||
PROSITE | PDOC00172 | ||||||||
SCOP | 3trx | ||||||||
Superfamilija | 3trx | ||||||||
CDD | cd01659 | ||||||||
|
Konzervacija sekvence uredi
Uprkos varijabilnosti sekvenci u mnogim regionima sklopa, tioredoksinski proteini imaju zajedničku sekvencu aktivnog mesta sa dva reaktivna cisteinska ostatka: Cys-X-Y-Cys, gde su X i Y obično hidrofobne aminokiseline. Redukovana forma proteina sadrži dve slobodne tiolne grupe na cisteinskim ostacima, dok oksidovana forma sadrži disulfidnu vezu između njih.
Primeri uredi
Ljudski proteini sa ovim domenom su :
Literatura uredi
- Creighton TE. (2000). Protein folding coupled to disulphide-bond formation. In Mechanisms of Protein Folding 2nd ed. Editor RH Pain. Oxford University Press.
Spoljašnje veze uredi
- SCOP thioredoxin superfamily Arhivirano 2011-05-16 na Wayback Machine-u
- CATH glutaredoxin topology Arhivirano 2007-03-12 na Wayback Machine-u