CARD domen
Domeni regrutovanja kaspaze (domeni kaspazne aktivacije i regrutovanja, CARD) su interakcioni motivi prisutni u širokom nizu proteina, tipično onih koji učestvuju u procesima vezanim za inflamaciju i apoptozu. Ovi domeni posreduju formiranje velikih proteinskih kompleksa putem direktnih interakcija između individualnih CARD domena. CARD domeni su prisutni u helikazama, kinazama, mitohondrijskim proteinima, kaspazama, i drugim citoplazmičnim faktorima.
| |||||||||
| Struktura RAIDD CARD.[1] | |||||||||
| Identifikatori | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Simbol | CARD | ||||||||
| Pfam | PF00619 | ||||||||
| InterPro | IPR001315 | ||||||||
| SMART | SM00114 | ||||||||
| PROSITE | PS50209 | ||||||||
| SCOP | 3crd | ||||||||
| Superfamilija | 3crd | ||||||||
| |||||||||
Osnovna svojstva uredi
CARD domeni su potklasa proteinskih motiva poznatih kao savijanje smrti, koji imaju karakterisčan raspored šest - sedam antiparalelnih alfa heliksa sa hidrofobnom osnovom i spoljašnjom stranom bogatom u naelektrisanim ostacima. Drugi motivi u ovoj klasi su pirinski domen (PYD), domen smrti (DD), i domen efektora smrti (DED), svi od kojih takođe prvenstveno deluju u regulaciji apoptoze i inflamatornog responsa.
CARD domeni u apoptozi uredi
CARD domeni su originalno bili karakterisani na osnovu njihovog učešća u regulaciji kaspazne aktivacije i apoptoze.[2] Osnovna šestoheliksna struktura domena je konzervirana od sisara sve do ced-3 i ced-4 gena kod C. elegans, organizma kod kojeg je nekoliko komponenti apoptozne mašinerije prvo okarakterisano. CARD motivi su prisutni u brojnim proteinima koji promovišu apoptozu, prvenstveno kaspazama 1,2,4,5,9, i 15 kod sisara.
Reference uredi
- ↑ Chou JJ, Matsuo H, Duan H, Wagner G (July 1998). „Solution structure of the RAIDD CARD and model for CARD/CARD interaction in caspase-2 and caspase-9 recruitment”. Cell 94 (2): 171–80. DOI:10.1016/S0092-8674(00)81417-8. PMID 9695946.
- ↑ Hofmann K, Bucher P, Tschopp J (1997). „The CARD domain: a new apoptotic signalling motif”. Trends Biochem Sci 22 (5): 155–6. DOI:10.1016/S0968-0004(97)01043-8. PMID 9175472.
Literatura uredi
- Hiscott J, et al. (2006). „MasterCARD: a priceless link to innate immunity”. Trends Mol Med 12 (2): 53–6. DOI:10.1016/j.molmed.2005.12.003. PMID 16406812.
- Ting JP, Williams KL (2005). „The CATERPILLER family: an ancient family of immune/apoptotic proteins”. Clin Immunol 115 (1): 33–7. DOI:10.1016/j.clim.2005.02.007. PMID 15870018.
- Martinon F, Tschopp J (2004). „Inflammatory caspases: linking an intracellular innate immune system to autoinflammatory diseases”. Cell 117 (5): 561–74. DOI:10.1016/j.cell.2004.05.004. PMID 15163405.
- Hong GS, Junk YK (2002). „Caspase recruitment domain (CARD) as a bi-functional switch of caspase regulation and NF-kappaB signals”. J Biochem Mol Biol 35 (1): 19–23. DOI:10.5483/BMBRep.2002.35.1.019. PMID 16248965.
- Bouchier-Hayes L, Martin SJ (2002). „CARD games in apoptosis and immunity”. EMBO Rep 3 (7): 616–21. DOI:10.1093/embo-reports/kvf139. PMC 1084193. PMID 12101092.