Bromodomen je proteinski domen koji prepoznaje acetilisane lizinske ostatke kao što su oni na N-terminalnim krajevima histona. Ovo prepoznavanje je često prerekvizit za protein-histon asocijaciju i hromatinsko remodelovanje. Ovaj domen poprima sve-α proteinski nabor, svežanj četiri alfa heliksa.[1][2]

Bromodomen
1e6i bromodomain.png
Vrpčani dijagram GCN5 bromodomena iz Saccharomyces cerevisiae, obojenog od plavog (N-terminus) do crvenog (C-terminus).[1]
Identifikatori
Simbol Bromodomen
Pfam PF00439
InterPro IPR001487
SMART SM00297
PROSITE PDOC00550
SCOP 1b91
Superfamilija 1b91
CDD cd04369

OtkrićeUredi

Bromodomen je identifikovao kao novi strukturni motiv Džon Tamkun sa saradnicima u tokin studiranja brm gena. Oni su ukazali na sličnost sekvence sa genima koji učestvuju u transkripcionoj aktivaciji[3].

Vidi jošUredi

LiteraturaUredi

  1. 1,0 1,1 PDB 1e6i; Owen DJ, Ornaghi P, Yang JC, Lowe N, Evans PR, Ballario P, Neuhaus D, Filetici P, Travers AA (November 2000). "The structural basis for the recognition of acetylated histone H4 by the bromodomain of histone acetyltransferase gcn5p". EMBO J. 19 (22): 6141–9. PMC 305837. PMID 11080160. doi:10.1093/emboj/19.22.6141. 
  2. Zeng L, Ming-Ming Zhou (February 2002). "Bromodomain: an acetyl-lysine binding domain". FEBS Lett. 513 (1): 124–8. PMID 11911891. doi:10.1016/S0014-5793(01)03309-9. 
  3. Tamkun JW, Deuring R, Scott MP, Kissinger M, Pattatucci AM, Kaufman TC, Kennison JA (February 1992). "brahma: a regulator of Drosophila homeotic genes structurally related to the yeast transcriptional activator SNF2/SWI2". Cell 68 (3): 561–72. PMID 1346755. doi:10.1016/0092-8674(92)90191-E.