Test razgranate DNK
U biologiji, test razgranate DNK je test pojačavanja signala koji se koristi za detektovanje molekula nukleinskih kiselina. Ovaj test se razlikuje od testa amplifikacije biološkog cilja.[1]
Test razgranate DNK se može koristiti za detekciju i kvantifikaciju mnogih tipova RNK ili DNK molekula. U testu se razgranata DNK pomeša sa testiranim uzorkom. Detekcija se vrši koristeći neradioaktivni metod, i prethodna amplifikacija nije neophodna. Test je u potpunosti zavistan od hibridizacije. Enzimi se koriste za indikaciju stepena hibridizacije, a ne za manipulaciju nukleinskih kiselina. Male količine nukleinske kiseline se mogu detektovati i kvantifikovati bez koraka reverzne transkripcije (u slučaju RNK) i/ili PCR. Test se može koristiti u visoko protočnom modu, za razliku od kvantitativnog Northern-blotting ili testa RNAzne protekcije, koji su radno intenzivni i nepodesni za primenu na veliki broj uzoraka. Druga značajna visoko protočna tehnika koje nalazi primenu u kvantifikaciji specifičnih RNK molekula je kvantitativna PCR, nakon reverzne transkripcije RNK do cDNK.[2]
Reference uredi
- ↑ D Kern, M Collins, T Fultz, J Detmer, S Hamren, J J Peterkin, P Sheridan, M Urdea, R White, T Yeghiazarian and J Todd (December 1996). „An enhanced-sensitivity branched-DNA assay for quantification of human immunodeficiency virus type 1 RNA in plasma”. J. Clin. Microbiol. 34 (12): 3196-3202.[mrtav link]
- ↑ Collins, M. L.; Irvine, B.; Tyner, D.; Fine, E.; Zayati, C.; Chang, C.; Horn, T.; Ahle, D.; Detmer, J.; Shen, L. P.; Kolberg, J.; Bushnell, S.; Urdea, M. S.; Ho, D. D. (1997). „A branched DNA signal amplification assay for quantification of nucleic acid targets below 100 molecules/ml”. Nucleic Acids Research 25 (15): 2979–2984. DOI:10.1093/nar/25.15.2979. PMC 146852. PMID 9224596.