Streptavidin
Streptavidin je protein sa masom 60 kDa koji se dobija iz bakterije Streptomyces avidinii. Streptavidinski homotetrameri imaju izuzetno visok afinitet za biotin (vitamin B7). Sa konstantom disocijacije (Kd) reda veličine ≈10−14 mol/L,[1] vezivanje biotina za streptavidin je jedna od najjačih nekovalentnih interakcija poznatih u prirodi. Streptavidin se ekstenzivno koristi u molekularnoj biologiji i bionanotehnologiji usled otpornosti streptavidin-biotin kompleksa na organske rastvarače, denaturante (npr. gvanidinijum hlorid), deterdžente (npr. SDS, Triton), proteolitičke enzime, i ekstremne temperature i pH.
| |||||||||
| Monomerni streptavidin sa vezanim biotinom (sfere) | |||||||||
| Identifikatori | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Simbol | |||||||||
| Pfam | PF01382 | ||||||||
| InterPro | IPR005468 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00499 | ||||||||
| SCOP | 1slf | ||||||||
| Superfamilija | 1slf | ||||||||
| |||||||||
Structura uredi
Kristalna struktura streptavidina sa vezanim biotinom je prvi put rešena 1989,[2] dok je februara 2012. Proteinska baza podataka sadržala 135 struktura ovog proteina.
Reference uredi
- ↑ Green, NM (1975). „Avidin”. Advances in protein chemistry 29: 85–133. PMID 237414.
- ↑ Hendrickson W. A. (1989). „Crystal Structure of Core Streptavidin Determined from Multiwavelength Anomalous Diffraction of Synchrotron Radiation”. Proceedings of the National Academy of Sciences 86 (7): 2190–4. DOI:10.1073/pnas.86.7.2190.
Literatura uredi
- Hutchens, T. W.; Porath, J. O. (1987). „Protein recognition of immobilized ligands: promotion of selective adsorption”. Clinical Chemistry 33 (9): 1502–8. PMID 3621554.
- Chodosh, Lewis A.; Buratowski, Stephen (2001). „Purification of DNA-Binding Proteins Using Biotin/Streptavidin Affinity Systems”. Current Protocols in Protein Science. 9.7.1–9.7.13. DOI:10.1002/0471140864.ps0907s12. ISBN 978-0-471-14086-3.
- Zimmermann, Ralf M.; Cox, Edward C (1994). „DNA stretching on functionalized gold surfaces”. Nucleic Acids Research 22 (3): 492–7. DOI:10.1093/nar/22.3.492. PMC 523609. PMID 8127690.