Gneja Pompeja ne treba miješati s njegovim ocem, poznatim kao Gnej Pompej Veliki ili "Pompej Veliki."

Gnej Pompej (Gnaeus Pompeius, cca. 75. pne. - 12. april 45. pne.), također poznat kao Pompej Mlađi (nekada navođen i kao Cneius ili Gneius) bio je Rimska Republika|rimski političar i vojskovođa iz doba kasne Republike.

Bio je sin vojskovođe i državnika Pompeja Velikog, te oženjen za Klaudiju Pulhru Mlađu, kćer Apija Klaudija Pulhera. Kada je godine 49. pne. suparništvo Pompeja i Julije Cezar|Cezara eskaliralo u građanski rat, priključio se očevoj vojsci i sudjelovao u Farsala. Nakon očevog poraza i ubistva se pridružio njegovim pristašama u Africi te sudjelovao u Bitka kod Tapsa|bitci kod Tapsa, nakon koje je opet morao bježati, ovaj put kod brata Seksta na Balearima. Kada je u Hispaniji krajem 46. pne. izbila pro-pompejanska pobuna, Tit Labijen i braća Pompej su se stavili na čelo pobunjenika. Cezar je pobunjeničku vojsku uništio u bitci kod Munde 17. marta 45. pne. i tako okončao građanski rat. Sekst je uspio pobjeći, ali je Gnej uhvaćen i po Cezarovom naređenju pogubljen. Prema Plutarhu, rimska javnost je s negodovanjem dočekala tu vijest, smatrajući nepriličnim da Cezar ubija djecu svog nekadašnjeg dobrog prijatelja.