Genetski kod – razlika između verzija

Uklonjeni sadržaj Dodani sadržaj
Kolega2357 (razgovor | doprinos)
m Bot: Automatska zamjena teksta (-[[category: +[[Kategorija:)
Kolega2357 (razgovor | doprinos)
m robot kozmetičke promjene
Red 5:
 
== Genom ==
[[imageDatoteka:Genetic_code.jpg|thumb|240px|right|DNK molekul]]
Sveukupna genetska informacija jednog organizma se zove '''genom''', i sva genetska informacija se nalazi na molekulu '''DNK'''. Svaki funkcionalni region molekula DNK se naziva [[gen]]. Svaki gen se putem procesa tranckripcije, transkriptuje u odgovarajući molekul [[Ribonukleinska kiselina|RNK]], koji se procesom translacije, prevodi u azbuku kojom se određuju amino kiseline. Proces translacije je moguć usled postojanja [[ribozom|ribozoma]]a (kao region sinteze proteina), enzima i grupe RNK molekula.
 
Sekvenca gena koja se nalazi na DNK i RNK molekulima se sastoji od po tro nukleodita i ta trojka čini jedinicu koju nazivamo '''kodon'''. Svaki kodon kodira jednu [[aminokiselina|amino kiselinu]]. Svaki nukleotid se sastoji od podgrupe koju čine fosfatna grupa, šećer deoksiriboze i jedna od četiri moguće azotne baze, koje su grupisane u po dve kategorije [[purin|purini]]i i [[pirimidin|pirimidini]]i. Purinske baze [[Adenin]] (A) i [[Guanin]] (G) su veće i sastoje se od po dva aromatična prstena. Pirimidinske baze [[Citozin]] (C) i [[Timin]] (T) su manje i sastoje se od jednog aromatičnog prestna. Kod molekula RNK Timin je zamenjen [[Uracil|Uracilom]]om (U) i šećer deoksiriboze je zamenjen šećerom [[riboza|riboze]].
 
Kako se kodon sastoji od po tri nukleotida, a postoje četiri različite baze, te su moguće 64 različite kombinacije 4<sup>3</sup> = 64. Na primer, RNK sekvenca 5'- UUUAAACCC -3', se sastoji od kodona UUU, AAA i CCC, i svaki od tri kodona kodira po tri amino kiseline. Tako da ova RNK sekvenca predstavlja sekvencu proteina, koji je dugačak tri amino koseline.
 
== Tabela 1: Standardni genetski kod ==
 
Standardni genetski kod je prikazan u tabeli 1.
Red 37:
<th>U</th>
<td>
UUU (Phe/F) [[Fenilalanin]]<br />
UUC (Phe/F) [[Fenilalanin]]<br />
UUA (Leu/L) [[Leucin]]<br />
UUG (Leu/L) [[Leucin]], ''Start''<br />
</td>
<td>
UCU (Ser/S) [[Serin]]<br />
UCC (Ser/S) [[Serin]]<br />
UCA (Ser/S) [[Serin]]<br />
UCG (Ser/S) [[Serin]]<br />
</td>
<td>
UAU (Tyr/Y) [[Tirozin]]<br />
UAC (Tyr/Y) [[Tirozin]]<br />
UAA Ochre (''Stop'')<br />
UAG Amber (''Stop'')<br />
</td>
<td>
UGU (Cys/C) [[Cistein]]<br />
UGC (Cys/C) [[Cistein]]<br />
UGA Opal (''Stop'')<br />
UGG (Trp/W) [[Triptofan]]<br />
</td>
</tr>
Red 65:
<th>C</th>
<td>
CUU (Leu/L) [[Leucin]]<br />
CUC (Leu/L) [[Leucin]]<br />
CUA (Leu/L) [[Leucin]]<br />
CUG (Leu/L) [[Leucin]], ''Start''<br />
</td>
<td>
CCU (Pro/P) [[Prolin]]<br />
CCC (Pro/P) [[Prolin]]<br />
CCA (Pro/P) [[Prolin]]<br />
CCG (Pro/P) [[Prolin]]<br />
</td>
<td>
CAU (His/H) [[Histidin]]<br />
CAC (His/H) [[Histidin]]<br />
CAA (Gln/Q) [[Glutamin]]<br />
CAG (Gln/Q) [[Glutamin]]<br />
</td>
<td>
CGU (Arg/R) [[Arginin]]<br />
CGC (Arg/R) [[Arginin]]<br />
CGA (Arg/R) [[Arginin]]<br />
CGG (Arg/R) [[Arginin]]<br />
</td>
</tr>
Red 93:
<th>A</th>
<td>
AUU (Ile/I) [[Izoleucin]], ''Start''<sup>2</sup><br />
AUC (Ile/I) [[Izoleucin]]<br />
AUA (Ile/I) [[Izoleucin]]<br />
AUG (Met/M) [[Metionin]], ''Start''<sup>1</sup><br />
</td>
<td>
ACU (Thr/T) [[Treonin]]<br />
ACC (Thr/T) [[Treonin]]<br />
ACA (Thr/T) [[Treonin]]<br />
ACG (Thr/T) [[Treonin]]<br />
</td>
<td>
AAU (Asn/N) [[Asparagin]]<br />
AAC (Asn/N) [[Asparagin]]<br />
AAA (Lys/K) [[Lizin]]<br />
AAG (Lys/K) [[Lizin]]<br />
</td>
<td>
AGU (Ser/S) [[Serin]]<br />
AGC (Ser/S) [[Serin]]<br />
AGA (Arg/R) [[Arginin]]<br />
AGG (Arg/R) [[Arginin]]<br />
</td>
</tr>
Red 121:
<th>G</th>
<td>
GUU (Val/V) [[Valin]]<br />
GUC (Val/V) [[Valin]]<br />
GUA (Val/V) [[Valin]]<br />
GUG (Val/V) [[Valin]], ''Start''<sup>2</sup><br />
</td>
<td>
GCU (Ala/A) [[Alanin]]<br />
GCC (Ala/A) [[Alanin]]<br />
GCA (Ala/A) [[Alanin]]<br />
GCG (Ala/A) [[Alanin]]<br />
</td>
<td>
GAU (Asp/D) [[Asparatinska kiselina]]<br />
GAC (Asp/D) [[Asparatinska kiselina]]<br />
GAA (Glu/E) [[Glutaminska kiselina]]<br />
GAG (Glu/E) [[Glutaminska kiselina]]<br />
</td>
<td>
GGU (Gly/G) [[Glicin]]<br />
GGC (Gly/G) [[Glicin]]<br />
GGA (Gly/G) [[Glicin]]<br />
GGG (Gly/G) [[Glicin]]<br />
</td>
</tr>
Red 151:
<sup>2</sup>Ovo je start kodon samo kod [[prokariote|prokariota]].
 
== Tabela 2: Amino kiseline i odgovarajući kodoni ==
<table border="1" cellpadding="3" cellspacing="0">
<caption>
Red 250:
 
=== Stop i Start Kodoni ===
U klasičnoj genetici, stop kodonima su data imena, na primer je UAG ''ćilibar'', je UGA ''opal'', i UAA ''oker''. Ova imena su ustvari originalno data specifičnim genima na kojima su kasnije detektovane mutacije ovih kodona, te kodoni po tim [[gen|genima]]ima nose imena.
 
Translacija počinje sa kodonom koji inicira sam proces, i taj kodon je '''start kodon'''. Međutim za razliku od '''stop kodona''', start kodon sam nije dovljan da bi [[translacija]] počela, jer su neophodni [[informativna RNK]] kao i [[ribozom|ribozomi]]i. Dok recimo, jedan stop kodon je dovoljan da se ceo proces zaustavi. Najčešći start kodon je AUG, koji takođe kodira i za amino kiselinu [[Metionin]]. CUG i UUG, i kod [[prokariote|prokariota]] GUG i AUU, takođe imaju ulogu start kodona, ali se češće pojavljuju.
 
=== Čitanje kodona ===
Red 259:
Način na koji se ovaj problem rešava je pomoću jasnog deifnisanja gde je start kodon. Tako da obično prvo pojavljivanje AUG sekvence u molekulu [[Ribonukleinska kiselina|RNK]] se uzima kao start kodon. [[Mutacija|Mutacije]] i greške prilikom DNK replikacije mogu znatno da utiču ili čak potpuno unište funkciju proteina.
 
=== Osobine genetičkog koda ===
Genetički kod pokazuje tri važne osobine: univerzalnost, izrođenost i očitava se bez preklapanja.
 
'''Univerzalnost''' znači da je genetički kod isti za sve biološke vrste, odnosno da pojedini kodoni u gotovo svim biološkim vrstama odgovaraju istoj aminokiselini .
 
'''Izrođenost''' (degenerativnost) genetičkog koda znači da jednu aminokiselinu najčešće određuje veći broj kodona . Kodoni koji određuju istu aminokiselinu često su vrlo slični i najčešće se razlikuju samo u trećem nukleotidu, tako da ako dođe do zamene nukleotida to ne predstavlja i zamenu aminokiseline u proteinu. Time se sprečavaju efekti [[ mutacije]] gena.
 
'''Očitavanje bez preklapanja''' znači da nukleotidi jednog kodona nikada ne pripadaju istovremeno i susednim kodonima. To se može slikovito uporediti sa rečenicom sastavljenom isključivo od troslovnih reči. Takvu rečenicu je moguće ispravno protumačiti jedino čitajući je bez preklapanja slova iz susednih reči: