Po raspadu [[SFRSocijalistička Federativna Republika Jugoslavija|Jugoslavije]] osnovan je 1992 [[Fudbalski savez Republike Srpske]], koji je u sezoni 1995/96 organizovao prvo takmičenje u fudbalu na teritoriji Republike Srpske. Drina je bila učesnik [[Prva liga Republike Srpske u fudbalu 1995/96.|Prve lige Republike Srpske 1995/96.]]. Igrala je u Grupi Istok ali je na kraju sezone zauzela pretposlednje mesto i ispala u [[Druga liga Republike Srpske u fudbalu|Drugu ligu]]. Posle samo jedne sezone Drina se kao prvak Druge lige grupa [[Bijeljina]] vraća u Prvu ligu [[Prvu ligu Republike Srpske u fudbalu 1997/98.|1997/98.]], ali ponovo ispada [[Prvu ligu Republike Srpske u fudbalu 1999/00.|1999/00.]]. Vratila se [[Prvu ligu Republike Srpske u fudbalu 2002/03.|2002/03.]] gde je ostala do danas.
U sezoni [[Prva liga Republike Srpske u fudbalu 2009/10.|2009/10.]] Drina je osvajanjem prvog mesta u [[Prva liga Republike Srpske u fudbalu|Prvoj ligi Republike Srpske]] postigla svoj do danas najveći uspeh plasirajući se u [[Premijer liga Bosne i Hercegovine u fudbalu|Premijer ligu Bosne i Hercegovine]].
