Gliceraldehid-3-fosfat dehidrogenaza
| edit |
Gliceraldehid-3-fosfat dehidrogenaza (GAPDH, G3PDH) (EC 1.2.1.12) je enzim sa masom od ~37 kDa, koji katalizuje šesti korak glikolize i stoga doprinosi procesu razlaganja glukoze radi oslobađanja energije. GAPDH učestvuje u nekoliko nemetaboličkih procesa, uključujući aktivaciju transkripcije, inicijaciju apoptoze,[1] i druge.
| Gliceraldehid-3-fosfat dehidrogenaza | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 GAPDH sa NAD+ i Pi vezanim za aktivno mesto. PDB prikaz baziran na 2CZC. | |||||||||||
| Dostupne strukture | |||||||||||
| 1U8F, 1ZNQ, 3GPD | |||||||||||
| Identifikatori | |||||||||||
| Simboli | GAPDH; G3PD; GAPD | ||||||||||
| Vanjski ID | OMIM: 138400 MGI: 3646088 HomoloGene: 107053 GeneCards: GAPDH Gene | ||||||||||
| EC broj | 1.2.1.12 | ||||||||||
| |||||||||||
| Pregled RNK izražavanja | |||||||||||
 | |||||||||||
 | |||||||||||
 | |||||||||||
| podaci | |||||||||||
| Ortolozi | |||||||||||
| Vrsta | Čovek | Miš | |||||||||
| Entrez | 2597 | 100043349 | |||||||||
| Ensembl | ENSG00000111640 | ENSMUSG00000078370 | |||||||||
| UniProt | P04406 | P16858 | |||||||||
| RefSeq (mRNA) | NM_001256799.1 | NM_008084 | |||||||||
| RefSeq (protein) | NP_001243728.1 | NP_001074766 | |||||||||
| Lokacija (UCSC) | Chr 12: 6.64 - 6.65 Mb | Chr 12: 71.02 - 71.02 Mb | |||||||||
| PubMed pretraga | [1] | [2] | |||||||||
Metabolička funkcija uredi
Gliceraldehid 3-fosfat dehidrogenaza (GAPDH) katalizuje konverziju gliceraldehid 3-fosfata do D-glicerat 1,3-bisfosfata.
Reakcija uredi
| gliceraldehid 3-fosfat | gliceraldehid fosfat dehidrogenaza | D-glicerat 1,3-bisfosfat | |
|
| ||
| NAD+ + Pi | NADH + H+ | ||
| |||
| NAD+ + Pi | NADH + H+ | ||
Jedinjenje C00118 u KEGG bazi podataka metaboličkig puteva. Enzim 1.2.1.12 u KEGG bazi podataka metaboličkig puteva. Reakcija R01063 u KEGG Metabolički Put bazi podataka. Jedinjenje C00236 u KEGG bazi podataka metaboličkig puteva.
Reference uredi
- ↑ A. Tarze, A. Deniaud, M. Le Bras, E. Maillier, D. Molle, N. Larochette, N. Zamzami, G. Jan, G. Kroemer, and C. Brenner (2007). „GAPDH, a novel regulator of the pro-apoptotic mitochondrial membrane permeabilization”. Oncogene 26 (18): 2606–2620. DOI:10.1038/sj.onc.1210074. PMID 17072346.
Literatura uredi
- Nicholas C. Price, Lewis Stevens (1999). Fundamentals of Enzymology: The Cell and Molecular Biology of Catalytic Proteins (Third izd.). USA: Oxford University Press. ISBN 019850229X.
- Eric J. Toone (2006). Advances in Enzymology and Related Areas of Molecular Biology, Protein Evolution (Volume 75 izd.). Wiley-Interscience. ISBN 0471205036.
- Branden C, Tooze J.. Introduction to Protein Structure. New York, NY: Garland Publishing. ISBN: 0-8153-2305-0.
- Irwin H. Segel. Enzyme Kinetics: Behavior and Analysis of Rapid Equilibrium and Steady-State Enzyme Systems (Book 44 izd.). Wiley Classics Library. ISBN 0471303097.
- Robert A. Copeland (2013). Evaluation of Enzyme Inhibitors in Drug Discovery: A Guide for Medicinal Chemists and Pharmacologists (2nd izd.). Wiley-Interscience. ISBN 111848813X.
- Gerhard Michal, Dietmar Schomburg (2012). Biochemical Pathways: An Atlas of Biochemistry and Molecular Biology (2nd izd.). Wiley. ISBN 0470146842.
- Donald Voet, Judith G. Voet (2005). Biochemistry (3 izd.). Wiley. ISBN 978-0-471-19350-0.
- Stryer, Lubert; Berg, Jeremy Mark; Tymoczko, John L. (2002). Biochemistry, Fifth Edition & Lecture Notebook. San Francisco: W. H. Freeman.
- Diagram of the GAPDH reaction mechanism from Lodish MCB at NCBI bookshelf
- Similar diagram from Alberts The Cell at NCBI bookshelf