Ciklično nukleotidna fosfodiesteraza
3'5'-ciklično nukleotidna fosfodiesteraza je familija fosfodiesteraza.[1] Ovi enzimi katalizuju sledeće reakcije:
| 3'5'-ciklično nukleotidna fosfodiesteraza | |
|---|---|
| |
| Ciklično nukleotidna fosfodiesteraza tetramer, Human | |
| Identifikatori | |
| Simbol | PDEase_I |
| Pfam | PF00233 |
| InterPro | IPR002073 |
| SKOP | 1f0j |
| 3',5'-ciklično-nukleotidna fosfodiesteraza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatori | |||||||||
| EC broj | 3.1.4.17 | ||||||||
| CAS broj | 9040-59-9 | ||||||||
| IntEnz | IntEnz view | ||||||||
| BRENDA | BRENDA entry | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme view | ||||||||
| KEGG | KEGG entry | ||||||||
| MetaCyc | metabolic pathway | ||||||||
| PRIAM | profile | ||||||||
| PDB | RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum | ||||||||
| Ontologija gena | AmiGO / EGO | ||||||||
| |||||||||
- nukleozid 3',5'-ciklični fosfat + H2O = nukleozid 5'-fosfat
gde je nukleozid 3',5'-ciklični fosfat: 3',5'-ciklični AMP, 3',5'-ciklični dAMP, 3',5'-ciklični IMP, 3',5'-ciklični GMP ili 3',5'-ciklični CMP.
Retinalna 3',5'-cGMP fosfodiesteraza (EC 3.1.4.17) (PDE) je locirana u spoljašnjem segmentu fotoreceptora.[2] Ona je svetlom aktivirana i učestvuje u prenosu signala. U štapićastim ćelijama PDE je oligomerna. Ona se sastoji od alfa-, beta- i 2 gama-podjedinaca, dok je PDE u kupastim ćelijama homodimer alfa lanaca, koji vezan za nekoliko manjih podjedinca. Oba PDE tipa katalizuju hidrolizu cAMP ili cGMP u korespondirajuće nukleozide 5' monofosfate. Oba enzima imaju veći afinitet za cGMP. Mesta cGMP vezivanja su locirana na N-terminalnoj polovini proteinske sekvence, dok se katalitički deo nalazi na C-terminalnom segmentu.
Humani proteini koji sadrže ovaj domen uredi
Reference uredi
- ↑ Donald Voet, Judith G. Voet (2005). Biochemistry (3 izd.). Wiley. ISBN 978-0-471-19350-0.
- ↑ Watson S, Arkinstall S (1994). Opsins. pp. 214–222.
Literatura uredi
- Nicholas C. Price, Lewis Stevens (1999). Fundamentals of Enzymology: The Cell and Molecular Biology of Catalytic Proteins (Third izd.). USA: Oxford University Press. ISBN 019850229X.
- Eric J. Toone (2006). Advances in Enzymology and Related Areas of Molecular Biology, Protein Evolution (Volume 75 izd.). Wiley-Interscience. ISBN 0471205036.
- Branden C, Tooze J.. Introduction to Protein Structure. New York, NY: Garland Publishing. ISBN: 0-8153-2305-0.
- Irwin H. Segel. Enzyme Kinetics: Behavior and Analysis of Rapid Equilibrium and Steady-State Enzyme Systems (Book 44 izd.). Wiley Classics Library. ISBN 0471303097.
- Robert A. Copeland (2013). Evaluation of Enzyme Inhibitors in Drug Discovery: A Guide for Medicinal Chemists and Pharmacologists (2nd izd.). Wiley-Interscience. ISBN 111848813X.
- Gerhard Michal, Dietmar Schomburg (2012). Biochemical Pathways: An Atlas of Biochemistry and Molecular Biology (2nd izd.). Wiley. ISBN 0470146842.