Retrovirusna integraze (IN) enzim je koji proizvode retrovirusi (poput HIVa), koji omogućavaju da se njihov genetički materijal integriše u DNK inficirane ćelije. Retrovirusni IN enzimi se razlikuju od fagnih integraza, poput λ fagne integraze (Int).
IN je ključna komponenta retrovirusnog preintegracionog kompleksa (PIC).
Svi retrovirusni IN proteini sadrže tri kanonička domena, povezana fleksibilnim sponama:
- N-terminusni HH-CC zink-vezujući domen (tri-heliksni svežanj je stabilizovan koordinacijom Zn(II) katjona)
- katalotičko sržni domen (RNazaH savijanje)
- C-terminusni DNK-vezujući domen (SH3 motiv)[1]
Kristalne i NMR strukture individualnih domena i 2-domenski konstrakti integraza iz HIV-1, HIV-2, SIV, i Rous Sarcoma Virusa (RSV) su poznati. Prva struktura je određena 1994.
Biohemijski i strukturni podaci sugerišu da retrovirusne integraze deluju kao tetrameri (dimeri dimera). Sva tri domena su važna za multimerizaciju i vezivanje viralne DNK. Tokom ranih 2010, rešene su kristalne strukture IN iz prototipnog PFV virusa sklopljene na viralnim DNK krajevima.[2]
Vanjske veze
uredi